肝内胆管癌：三级淋巴结构异质性的时空图谱（214 + 155 例 + 空间多组学）
Science Advances · 2026-09-09 · 期刊论文 肝内胆管癌（iCCA）预后极差、治疗选择有限。本研究构建了三级淋巴结构（TLS）的 多模态空间图谱 ，确认 肿瘤内 TLS（iTLS）为独立预后标志物 。 蛋白组学：
利什曼原虫起始密码子序列调控翻译偶联mRNA降解
在利什曼原虫中，起始密码子周边序列（Kozak序列）被提示参与翻译起始偶联的mRNA降解，进而影响蛋白表达与转录本丰度；该结论基于预印本，证据档位为C，尚不足以下结论。 研究采用生物信息学比较与转基因L. donovani株系实验：在锥虫基因组中比对Kozak序列偏好，并构建由不
肝内胆管癌：三级淋巴结构（TLS）的时空图谱与成熟连续谱
规模：多模态空间图谱；蛋白组 214 例发现 + 155 例验证，证明瘤内 TLS（iTLS）是独立预后标志物，并建立四层 TLS 微环境分类与随机森林 TLS 预测分类器。 结构：成像质谱流式（IMC）显示 iTLS⁺ 肿瘤具结构化免疫架构——M1 样组织驻留巨噬细胞、树突细胞
人脑疾病单核转录组关联研究：细胞类型与跨 ancestry 图谱
该研究提示，基于单核表达谱构建的转录组插补模型可在主要脑细胞类型中定位遗传调控表达，并揭示大量在 bulk 组织分析中检测不到的基因—性状关联；跨 ancestry 分析支持这些关联的可重复性，方向为正向发现，但属观察性遗传学证据，尚不足以下因果结论。 研究设计为转录组范围关联研
血浆蛋白组学对新诊断原发中枢神经系统淋巴瘤的预后分层
在新诊断原发中枢神经系统淋巴瘤（PCNSL）患者中，基于基线血浆蛋白组学可划分出两种蛋白组状态，其中炎症型状态与更短的总生存和无进展生存相关，提示其可能具有预后分层价值。 研究为预后标志物开发与验证设计，纳入法国LOC网络162例新诊断PCNSL患者基线血浆，训练集84例、测试集
HIV-1 Vpr诱导原代CD4+ T细胞B细胞样表型
结论：多组学分析提示，HIV-1 Vpr可在原代CD4+ T细胞中诱导B细胞样转录程序，方向为促进B细胞相关基因表达；该发现属机制探索性结果，尚不足以推断临床意义。 研究设计与做法：采用整合多组学方法，在急性感染条件下识别HIV-1 RNA阳性CD4+ T细胞；通过Vpr过表达与
Chemerin-CMKLR1信号与盐敏感性高血压免疫代谢障碍
结论：在30例高血压成人的住院盐负荷/限盐方案中，血浆chemerin在限盐期升高并与盐敏感性及收缩压相关，提示chemerin-CMKLR1信号可能参与盐敏感性高血压的免疫代谢障碍，但证据档位为小样本观察性研究，不足以下因果结论。 设计与做法：研究为小样本住院盐敏感性方案，纳入
慢性肾病：肾脏昼夜节律转录组的"适应不良重编程"
对 CKD 与对照小鼠肾组织做 4 小时间隔时序 RNA-seq，用 JTK_CYCLE 判定节律基因，并分为"丢失 / 获得 / 保持"三类。 总体：肾脏节律谱被大幅改写，"获得节律"是主导模式，核心钟基因表达被打乱。 免疫炎症侧：CKD 中上调的获得节律基因富集于免疫炎症通路
原发性纤毛运动障碍：首次解析"过渡区"原位结构，锁定两个致病基因
问题：纤毛过渡区（TZ）负责调控纤毛蛋白质组构成，但其分子结构、蛋白组成及对运动性纤毛病的贡献一直未被定义。 对人体多纤毛上皮细胞做原位冷冻电子断层扫描 + 亚断层平均，在亚纳米分辨率下解析 TZ 特异的二联微管，并鉴定出 9 个组成蛋白。 关键发现：ECT2L 与 DZANK1
同基因前脑类器官揭示戈谢病早期神经发育改变与神经元高兴奋性
结论：在患者来源iPSC构建的同基因前脑类器官与2D网络中，戈谢病表现为早期脂质代谢紊乱及皮层高兴奋性，提示兴奋/抑制失衡；证据来自体外模型，属预印本，尚不足以直接外推至临床。 设计：建立健康对照与戈谢病患者来源iPSC，并工程化为同基因对照与疾病细胞系，据此生成皮层与皮层下前脑
GCB-DLBCL高CNV暗区恶性细胞状态与不良预后
在GCB-DLBCL中，单细胞与批量转录组整合分析识别出一个高拷贝数变异（CNV）、富集暗区样程序的恶性细胞状态M-C2，其丰度升高与总生存期较差相关，并伴抗原呈递能力下降。 研究整合单细胞转录组与推断CNV分析刻画恶性B细胞状态，采用调控子分析、功能注释与scPAGWAS探讨调
贝莱斯芽孢杆菌A5抑制烟草根腐病及真菌几丁质代谢基因表达
结论方向：A5菌株在平板对峙中对4种烟草根腐病相关镰刀菌表现广谱拮抗，并可影响病原菌UDP-N-乙酰葡糖胺相关代谢基因表达，提示其可能作为烟草根腐病生防候选资源；证据档位C，属实验室层面提示性结果。 研究设计与做法：从烟草根际分离100株细菌，用平板对峙法筛选获得广谱拮抗菌A5；
Scanpy：Python 单细胞基因表达数据分析工具包
Scanpy 是与 anndata 共同构建的单细胞基因表达数据分析工具包，覆盖预处理、可视化、聚类、轨迹推断与差异表达检验。
基因分型肥厚型心肌病代谢组学生物标志物与代谢重塑系统综述
该系统综述提示，在遗传学特征明确的肥厚型心肌病（HCM）人群中，代谢重塑主要表现为脂肪酸氧化、支链氨基酸代谢、酮体利用、三羧酸循环中间产物及脂质代谢等通路的反复改变，但未发现与特定肌节基因变异相对应的独特代谢特征；相关证据多来自小样本横断面研究，尚不足以支持临床转化。 研究为系统
黄颡鱼鳃急性低氧单细胞图谱：上皮细胞与红细胞响应
结论方向：该研究构建了黄颡鱼鳃组织单细胞图谱，提示急性低氧及复氧下鳃细胞类型存在差异化响应，证据档位为C，属描述性图谱研究，不足以下因果结论。 设计与做法：采用单细胞测序结合组织学观察，处理为急性低氧后复氧模型，对照与具体低氧参数、复氧时长、重复数材料未报告；共采集37,090个
慢性肾病的炎症与代谢"昼夜节律重编程"（4 小时间隔时序 RNA-seq）
Renal Failure · 2026-09-06 · 期刊论文 对对照与 CKD 小鼠肾脏组织做 4 小时间隔的时序 RNA 测序 ，用 JTK_CYCLE 算法识别节律基因并按"丢失 / 获得 / 维持"分类，再做聚焦式生物信息分析。
系统性红斑狼疮：CD3×CD19 双抗 A-319 的 I 期结果（12 人 / 52 周）
立题：抗 CD19 CAR-T 深度清除 B 细胞可在难治性自身免疫病带来持久无药缓解，但需淋巴清除化疗、自体细胞制备与专门设施，可及性受限。双特异性 T 细胞衔接器（TCE）是"现货型"替代方案，但在风湿病领域缺对照性临床评估。 设计：该药首次用于本病的 I 期试验静脉治疗臂；
单细胞状态转变的可解释球面几何：主导主成分投影
研究提出SPHERE-PCA方法，将单细胞基因表达的主导主成分投影到单位球面，以获得可解释的坐标系统。 方法对前三个主成分坐标做L2归一化，将生物学定义的根节点对齐北极，用测地距离θ、角位置φ与投影前径向幅度r表示每个细胞。
多组学整合揭示PRKCB低表达与肺腺癌不良预后及免疫微环境重塑
结论方向：多组学分析提示PRKCB在肺腺癌中下调，低表达与更差的总生存和无病生存相关，并提示其参与免疫微环境重塑；证据来自公共数据库与生物信息学推断，属提示性而非因果证实。 研究设计与做法：基于公共数据库的回顾性生物信息学分析，使用UCSC泛癌数据集（n=15776）、TCGA-
原发中枢神经系统淋巴瘤分子病理与诊疗转化综述
该综述提示，整合液体活检与多组学分子分型可能推动原发中枢神经系统淋巴瘤（PCNSL）诊断精细化，并催生免疫调节剂、激酶抑制剂及CAR-T等新策略，但均处于转化探索阶段，尚不足以支持临床常规应用。 研究设计为叙述性综述，围绕PCNSL分子病理、临床相关分子亚分类、新兴治疗与下一代诊
