基于Metal Mer的金属酶从头设计流程及锌、铁催化变体构建
研究提出一条可直接从计算获得高效金属酶的流程,以Metal Mer结构单元高置信度构建金属结合位点,所设计锌依赖氢转移酶变体在13种底物上ee>99%且无需定向进化;铁催化烯烃双官能化变体亦具初始活性,证据提示该流程可扩展金属酶可及反应范围。 为计算设计与实验验证相结合的方法学研
研究提出一条可直接从计算获得高效金属酶的流程,以Metal Mer结构单元高置信度构建金属结合位点,所设计锌依赖氢转移酶变体在13种底物上ee>99%且无需定向进化;铁催化烯烃双官能化变体亦具初始活性,证据提示该流程可扩展金属酶可及反应范围。 为计算设计与实验验证相结合的方法学研
通过孟德尔随机化等遗传学方法,为睡眠障碍筛选出具有遗传学支持的候选靶点并探索药物重定位方向。 采用双向两样本孟德尔随机化分析睡眠障碍与常见脑疾病的关系,并结合SMR、HEIDI及共定位分析整合pQTL与eQTL数据。
该研究提示,将Kirkwood-Buff理论推广至任意独立热力学组分数目的多组分水溶液后,可由分子动力学轨迹估算水活度,计算结果再现了主要实验趋势,但属方法学探索,尚不足以作为定量标准。 设计为分子动力学模拟方法学研究:以KB理论为基础,采用广义公式对所需化学势导数进行数值求解,
结论:桔梗皂苷D(PD)在无脂质负荷的血管损伤模型中可抑制新生内膜形成,但在高脂血症背景下加重早期动脉粥样硬化,其血管结局依脂质与血流情境而定,属证据支持的方向性结论,但强度受模型与样本量限制。 设计:整合网络药理学、分子对接、100 ns分子动力学模拟、血管平滑肌细胞(VSMC
研究构建并验证了一套深度学习计算流程,用于预测HDAC8抑制剂的活性强度。 整合化学信息学、神经网络、分子对接与分子动力学模拟,基于ChEMBL中4583个HDAC8抑制剂实验pIC50数据建模。
研究通过从头设计构建半合成导电蛋白孔道。 摘要缺失,无法获知具体设计策略与实验方法。
在Vero细胞中,新合成的噻唑基脲类化合物DFMNTU对黄热病毒17D株诱导的细胞病变具有抑制作用,并提示宿主激酶CK2为其可能靶点;该结果属体外与计算层面的早期hit发现,尚不足以支持体内或临床抗病毒结论。 研究为体外细胞学与计算机辅助药物发现研究:合成DFMNTU并经NMR、
结构设计:水热法合成两个新铜基配位聚合物 Cu-CP-1 与 Cu-CP-2,目标是同时延缓尿素水解与抑制硝化,以提高氮肥利用率。 活性:尿素酶抑制 IC₅₀ 分别为 3.40 ± 0.01 µM 与 9.15 ± 0.04 µM,显著优于其有机配体与参照抑制剂。 机制:动力学
RNA Biology · 2026-09-02 · 期刊论文 用"可缩放磁力光谱(MFS)"并行分析数百单分子,在高 / 低镁条件下测量 SAM / SAH 与 SAM-I 核开关的结合亲和力,结果与 SPR、ITC 一致,还额外给出构象
研究结合荧光淬灭、ANS结合、FRET与分子对接,表征溶菌酶部分折叠中间态的结构与热力学特征。 以丙烯酰胺和碘离子作淬灭剂考察极端pH下溶菌酶构象变化,并用GuSCN、HFIP和TFE诱导构象改变。