单细胞与空间转录组揭示结直肠癌肝转移C3中心多细胞生态

Functional & Integrative Genomics · 2026-11-09 · 期刊论文

• 一句话结论：结论方向：整合单细胞与空间转录组提示结直肠癌肝转移存在以罕见C3恶性状态为中心、空间可变的多细胞生态，并关联MAPK相关网络脆弱点；为计算性发现，需实验验证，属「提示」级。
• 研究设计与做法：设计为多模态计算研究：整合136,995细胞单细胞图谱、拷贝数推断、共识非负矩阵分解、调控网络与轨迹分析、细胞通讯建模、4张Visium切片、bulk队列生存分析、虚拟敲除、连接图谱筛选与分子对接；随访时长材料未报告。
• 主要结果：主要结果：沿C1—C2—C3连续谱解析出三种恶性上皮程序，C3呈分泌、侵袭与上皮—间质转化特征并关联更短无复发生存；INHBA–CST6–LBH–FSTL3评分在TCGA中与复发相关并获部分外部验证；具体风险比与p值材料未报告。
• 机制或解释：作者解释：Fib-COL10A1成纤维细胞与Endo-GJA5内皮细胞构成复现性基质—血管支架，CTSL程序巨噬细胞占据局灶界面；空间通路分析提示MAPK与VEGF相关活性，虚拟敲除提示CST6/LBH网络汇聚效应。
• 局限与边界：局限与边界：作者自述框架为计算性、需实验验证；外部验证仅部分；Visium切片仅4张；对接仅对CST6提供探索性结构支持而非LBH；材料未报告利益冲突。
• 可否落地：可否落地：为CRLM分层与MAPK相关靶点提供假设，连接图谱提名PD-0325901为候选逆转药物；属「提示」级，尚不足以下结论。

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Feifei Ma, Yige Yu

本文摘自《每日前沿研究简报 · 2026-11-09》「生物信息 / 组学（单细胞·差异表达）」。本内容仅用于研究信息整理与科普交流，不构成医疗建议。