标签:生命科学

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FMOD标记前列腺癌低恶性上皮状态:基于TCGA构建四基因ECM预后特征并作单细胞与功能验证

研究基于TCGA-PRAD数据构建4基因细胞外基质相关基因预后特征,用于预测无病间期;其中枢纽基因FMOD保护作用最强,虽在肿瘤组织中总体表达更高,却预示更好的临床结局,并在体外敲低实验中表现为抑制增殖。该结果属「提示」档位,尚需前瞻性验证。 研究为预后标志物开发与验证研究:利用

ProST:图像提示引导的多模态表征学习用于空间域识别

作者提出ProST框架,在多个空间转录组数据集上报告其在空间域识别、可视化、空间轨迹推断与基因表达填补方面一致优于现有方法;该结论基于作者自选数据集的基准比较,属方法学提示性证据,尚不足以断言普适优越性。 研究为计算方法的开发与基准评测,非临床研究。ProST以组织学图像作为图像

部分降低RAD21与CTCF对人iPSC来源内皮细胞染色质与FLI1结合的影响

在等基因人iPSC与iPSC来源内皮细胞(iEC)体系中,将CTCF或黏连蛋白核心亚基RAD21降至约50%水平后,内皮细胞出现启动子区CTCF与RAD21占据的明显丢失,且RAD21降低对内皮基因表达的影响强于CTCF降低,并伴随FLI1结合的全基因组重分布;证据支持RAD21

硫源驱动IGTS8燃料脱硫菌基因表达全局重塑的RNA-seq研究

在燃料生物脱硫条件下,模式菌株Rhodococcus qingshengii IGTS8的转录组随硫源与生长阶段发生广泛重排,其中对数后期转录响应最强;作者据此提示该状态下的细胞优先维持稳态与保护,而非增殖。 采用时间序列比较RNA-seq设计,将IGTS8分别以二苯并噻吩(DB

多模态MRI生境联合Transformer病理组学预测成人弥漫性胶质瘤高危分子亚型

结论方向:研究提示跨尺度联合模型对成人弥漫性胶质瘤高危分子亚型的预测表现优于单一MRI生境模型与病理深度学习模型,且模型风险分层与生存差异及细胞外基质相关转录特征存在关联;属回顾性建模研究。 研究设计与做法:回顾性收集456例成人弥漫性胶质瘤患者的术前MRI、术后全切片病理图像、

慢性肾病:肾脏昼夜节律转录组的"适应不良重编程"

对 CKD 与对照小鼠肾组织做 4 小时间隔时序 RNA-seq,用 JTK_CYCLE 判定节律基因,并分为"丢失 / 获得 / 保持"三类。 总体:肾脏节律谱被大幅改写,"获得节律"是主导模式,核心钟基因表达被打乱。 免疫炎症侧:CKD 中上调的获得节律基因富集于免疫炎症通路

应激冻结样反应抵抗力的特质性血清蛋白质组特征:20对20对照研究

在生态效度较高的模拟武装袭击情境中,有经验的快速反应警员对冻结样反应(面对攻击时无反应)的抵抗程度明显高于未受训个体;作者据此提示,这种抵抗可能与稳定的特质性血清蛋白质组特征相关,而非急性应激反应过程。 采用非靶向血清蛋白质组学比较两组人群:未受训个体20例与有经验的警察快速反应