标签:每日前沿

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MolSanitizer:面向大规模虚拟筛选的开源小分子数据库准备流程

结论:MolSanitizer作为基于RDKit的开源分子准备流程,在基准测试中表现优于若干免费软件,并与商业软件性能相当,提示其可用于大规模虚拟筛选前的数据库准备,证据档位C。 设计与做法:为工具开发与基准测试类研究,构建开源流程,包含化学环境感知的质子化与互变异构规则、系统性

BigMixSolDB:用 LLM 从 PDF 抽取混合溶剂溶解度数据库(带不确定性量化)

问题:化学文献中大量物理数据分散在非结构化文本与复杂表格里;将其转为机器可读格式是训练数据驱动化学模型的前提。但计算抽取的数据集普遍缺乏不确定性量化,导致人工抽取与整理仍不可省。 方案:一个完全自动化、带不确定性量化的抽取流水线 —— 用 LLM 直接从科学 PDF 中抽取复杂表