从头设计黄素蛋白并调控其激发态动力学
结论方向:该预印本报告了一套计算设计框架,可在从头设计蛋白中调控黄素的激发态行为,并据此获得热稳定的黄素结合蛋白;属设计验证性结果,尚不足以支持任何应用层面的结论。 设计与做法:研究为计算设计加超快光谱表征的整合研究,结合蛋白设计、QM/MM MD 与电子结构计算,迭代设计得到
结论方向:该预印本报告了一套计算设计框架,可在从头设计蛋白中调控黄素的激发态行为,并据此获得热稳定的黄素结合蛋白;属设计验证性结果,尚不足以支持任何应用层面的结论。 设计与做法:研究为计算设计加超快光谱表征的整合研究,结合蛋白设计、QM/MM MD 与电子结构计算,迭代设计得到
该计算研究提示,针对多重耐药密歇根克雷伯菌(K. michiganensis)ATCC 8724株设计的多表位疫苗(MEV)在免疫信息学层面具备候选潜力,但作者明确指出仍需进一步实验验证,因此当前证据不足以支持其实际保护效果。 研究设计为计算系统免疫学与多尺度建模,非体内或体外实
背景:N 端乙酰转移酶 A(NatA)催化真核生物 40–57% 的 Nα-乙酰化,此前没有任何经验证的小分子探针。 发现:从约 700 个化合物的内部库中筛出 tideglusib(YD3139,已进入临床的 GSK-3β 抑制剂),经噻二唑烷二酮骨架结构优化后,对酵母与人 N
结论:桔梗皂苷D(PD)在无脂质负荷的血管损伤模型中可抑制新生内膜形成,但在高脂血症背景下加重早期动脉粥样硬化,其血管结局依脂质与血流情境而定,属证据支持的方向性结论,但强度受模型与样本量限制。 设计:整合网络药理学、分子对接、100 ns分子动力学模拟、血管平滑肌细胞(VSMC
通过孟德尔随机化等遗传学方法,为睡眠障碍筛选出具有遗传学支持的候选靶点并探索药物重定位方向。 采用双向两样本孟德尔随机化分析睡眠障碍与常见脑疾病的关系,并结合SMR、HEIDI及共定位分析整合pQTL与eQTL数据。
研究提示木犀草素可能通过ERK1/2-GATA4通路抑制氧化应激与内皮间质转化,减轻心肌纤维化。 大鼠经皮下注射异丙肾上腺素7天诱导心肌纤维化,随后给予木犀草素处理。
结论(计算预测层面):基于网络药理学与分子模拟,衍生物A20被预测可结合PTP1B非竞争性变构位点,并显示较优的结合能、轨迹稳定性与类药性,作者据此将其定位为待实验验证的先导候选;该结论属计算预测,尚不足以作为疗效结论。 设计与做法:研究为纯计算机模拟研究,未涉及人体或动物实验。
数据:从 FAERS 提取 avacopan 相关个例安全报告 5,293 份、含 11,901 个不良事件术语,并与 JADER、EudraVigilance 交叉验证。 不成比例分析(ROR + BCPNN):感染、胃肠疾病与肝胆疾病信号阳性;药物性肝损伤、黄疸、胆汁淤积、胆
SKQ1经筛选被鉴定为可与美罗培南协同、用于对抗产NDM-1大肠埃希菌的潜在增效剂。 通过表面等离子共振筛选发现SKQ1,并以肉汤微量稀释棋盘法检测其与美罗培南的联合作用。
该研究提示,将Kirkwood-Buff理论推广至任意独立热力学组分数目的多组分水溶液后,可由分子动力学轨迹估算水活度,计算结果再现了主要实验趋势,但属方法学探索,尚不足以作为定量标准。 设计为分子动力学模拟方法学研究:以KB理论为基础,采用广义公式对所需化学势导数进行数值求解,