标签:化学信息 药物发现

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三维深度神经网络预测结合能加速结核配体筛选

结论:在InhA这一结核靶点、全柔性受体工作流与精选配体集合内,三维深度神经网络可在对接前预估结合能,与对接趋势呈中等相关,提示其作为预筛选手段具有可行性。 研究设计与做法:为计算模拟研究,构建全柔性受体模型并生成20000个构象,采用InhA结合口袋静电电荷分布的三维体素表示;

基于结构的肽聚糖生物合成抑制剂发现与抗菌评价

结论方向:该研究提出一套整合的基于结构策略,用于识别和表征潜在肽聚糖生物合成抑制剂,覆盖靶点选择、虚拟筛选、分子对接、构效关系分析与抗菌评价;材料未报告具体抗菌活性数据,故仅提示该策略具备筛选潜力,尚不足以下结论。 研究设计与做法:属计算与结构导向的发现型研究,围绕MurA、Mu

川芎来源协同抗真菌剂ligustrumdiol A的全合成与机制

结论方向:题名提示该工作报道了来自川芎(Ligusticum chuanxiong)的化合物ligustrumdiol A的全合成、生物评价与作用机制,并称其为协同抗真菌剂;但材料仅给出出版信息,未提供任何结果数据,故无法判断效应方向与强度。 研究设计与做法:材料未报告研究设计与

从头设计黄素蛋白并调控其激发态动力学

结论方向:该预印本报告了一套计算设计框架,可在从头设计蛋白中调控黄素的激发态行为,并据此获得热稳定的黄素结合蛋白;属设计验证性结果,尚不足以支持任何应用层面的结论。 设计与做法:研究为计算设计加超快光谱表征的整合研究,结合蛋白设计、QM/MM MD 与电子结构计算,迭代设计得到

体力活动改善骨骼肌胰岛素敏感性的计算生物标志物与化合物筛选

结论:该假设生成型研究提示WNT4可能参与骨骼肌胰岛素敏感性的动态调控,并提出“内源性代偿—阶段转换”功能假说及候选化合物库;所有发现均为计算预测,方向为提示性,尚不足以下结论。 设计与做法:整合生物信息学与计算化学,使用公共数据集;骨骼肌数据集GSE24215(n=10)为卧床

多表位疫苗计算设计靶向耐药密歇根克雷伯菌

该计算研究提示,针对多重耐药密歇根克雷伯菌(K. michiganensis)ATCC 8724株设计的多表位疫苗(MEV)在免疫信息学层面具备候选潜力,但作者明确指出仍需进一步实验验证,因此当前证据不足以支持其实际保护效果。 研究设计为计算系统免疫学与多尺度建模,非体内或体外实

基于分子对接的胸苷酸合成酶抑制剂预测

结论:作者以5-氟尿嘧啶(5-FU)为先导设计6个潜在人胸苷酸合成酶(hTS)抑制剂,对接结果显示多数设计化合物与hTS结合亲和力较强、结合模式与5-FU相似;属计算预测层面的提示性证据。 设计与做法:计算机模拟(in silico)研究,以5-FU为先导化合物设计6个hTS抑制