基于可操作扰动蛋白质组学的"虚拟细胞"模型 ProteinTalks(Nature)
Nature · 2026-09-09 · 期刊论文 研究从 系统性扰动的乳腺癌细胞系 中产生超过 3800 万条时序蛋白丰度测量 ,并据此构建虚拟细胞模型 ProteinTalks:其核心是大规模动态蛋白组资源与模型架构的协同,形成一种从
Nature · 2026-09-09 · 期刊论文 研究从 系统性扰动的乳腺癌细胞系 中产生超过 3800 万条时序蛋白丰度测量 ,并据此构建虚拟细胞模型 ProteinTalks:其核心是大规模动态蛋白组资源与模型架构的协同,形成一种从
以可回收离子液体催化、无溶剂条件合成20个咪唑并[1,2-a]嘧啶衍生物,并评价其抗菌与抗癌潜力。 采用二异丙基乙基铵庚酸酯[DIPEA][C6COO]催化,无溶剂合成KTI-1至KTI-20,并开展抗菌、KB-31细胞毒、分子对接、动力学模拟及ADMET与成药性分析。
化学方向雷达:多维虚拟筛选流水线化、重定位与靶点证据整合、AI模型对齐化学家判断。本期语料里计算类条目占据压倒性多数,提问方式已从“这个化合物有没有活性”转向“用什么模型、什么参数、什么靶点构象去筛”。
定位:回顾近二十年植物天然产物分离的转变 —— 从耗时试错走向理性、数据驱动、环境友好。 提取环节:从传统溶剂萃取转向可持续技术,包括天然深共晶溶剂(NADES),以及超声/微波辅助提取等混合能量传递方法 —— 对热不稳定化合物有更高产率与选择性。 分离环节:液-液分配色谱的进展
在300 K下模拟4000 ns,考察不同浓度P188对两种完整AAV8衣壳结构稳定性与聚集行为的影响。 采用粗粒化分子动力学方法,分析质心间距、残基接触、表面覆盖度、范德华作用、回转半径与相对形状各向异性等指标。
OpenFermion 是一个开源 Python 包,用于编译和分析模拟费米子系统(包括量子化学)的量子算法,提供费米子与量子比特哈密顿量的表示与操作工具。
PennyLane 是开源量子软件平台,支持量子计算、量子机器学习和量子化学,通过自动微分把量子电路与经典机器学习框架连接起来。
研究以BoNT/A催化域为靶点,通过药物库的基于结构虚拟筛选与分子动力学模拟寻找新型金属蛋白酶抑制剂。 BoNT/A催化域与嗜热菌蛋白酶结构特征及锌依赖活性相似,为靶向相关蛋白酶机制的设计提供基础。
体外筛选提示,合成的吡唑基哌啶酮/8-氨基吲哚里西啶杂合物中化合物18b对A549细胞活性最强,IC50为22.46±3.03 μM,与顺铂(22.06±2.57 μM)相近,对HEK293细胞毒性较低,选择性指数2.78;该结果属细胞水平初步提示,尚不足以支持临床抗癌结论。 研
结论方向:该铬酰-萘基(HCNP)供体-π-受体分子转子在黏度升高时荧光增强,而与人血清白蛋白(HSA)作用时主要表现为吸收红移而非荧光开启,二者被解耦为两种可区分的读出信号;证据档位为C,属探针表征类基础研究。 研究设计与做法:为分子探针的光物理表征与结合研究,非临床或动物实验
标题提示醛类可通过三羰基化级联反应实现苏糖呋喃糖的从头合成。 因仅有标题、无摘要,反应条件、催化剂与底物范围等设计细节不明。
该综述提示,RNA作为小分子药物靶点长期开发不足,2020年risdiplam获批表明折叠RNA可存在可成药口袋;但计算方法的成熟度仍受限,整体证据档位为B,属领域现状梳理而非疗效结论。 研究设计为叙述性综述,材料未报告纳入文献数量与检索策略。综述围绕RNA的构象动态骨架、缺乏特
该综述整合吡嗪酮衍生物的自然来源、合成途径、构效关系与临床转化前景。 作者称其为首个将上述四方面纳入同一框架的综述,并跨九个治疗领域识别结构决定因素。
研究以人工智能引导策略发现真菌麦角甾醇衍生物,作为靶向胶质母细胞瘤胆固醇依赖的选择性LXRβ激动剂。 针对GBM对外源胆固醇的共同依赖及LXRβ作为中枢神经系统胆固醇外排主要调控因子,构建整合性AI方法筛选LXRβ选择性、可透过血脑屏障且避免LXRα共激活肝毒性的激动剂。
结论:作者合成了一系列苯并咪唑-1,2,3-三唑杂合物,体外筛选提示氟代衍生物对革兰阳性菌和真菌活性增强、甲氧基取代物对革兰阴性菌活性较好,其中化合物 7b 与 7f 活性最具前景;该结论为体外筛选与对接层面的「提示」,尚不足以支持临床有效性。 设计与做法:属化学合成与体外活性筛
基于QSAR预测与欧盟统一分类,评估欧盟市售油基润滑剂成分的毒理学潜力,服务于危害表征与安全设计。 自安全数据表提取152种成分CAS号构建178种产品的Product-DB,并汇编丹麦产品注册库1032种成分的Registry-DB。
集成多种归纳偏置模型,可使逆合成预测更贴近化学家的判断方式。 研究采用模型集成策略,将具有不同归纳偏置的模型组合用于逆合成任务。
该文以生物基前体合成非异氰酸酯聚氨酯所需的双羟烷基氨基甲酸酯与双氨基甲酸酯。 摘要仅含出版信息,具体合成路线与表征方法未在摘要中呈现。
β-侧柏素在非小细胞肺癌细胞中表现出浓度依赖性细胞毒性。 以H460、A549肺癌细胞及L132正常肺上皮细胞为对象,采用MTT、NRU、SRB法检测。
结论方向:综述认为近二十年计算、生物与工程进展正逐步改变药物研发流程,AI/ML、多组学、基因编辑、类器官与精准医学等新策略已渗透各阶段;证据档位为C,属叙述性综述,方向为总体积极但未给出量化效应。 研究设计与做法:为叙述性/批判性综述,非原始研究;材料未报告样本量、干预与对照、