苯基二氮烯连接苯并咪唑–三唑杂合物的合成、抗菌活性与分子对接
结论：作者合成了一系列苯并咪唑-1,2,3-三唑杂合物，体外筛选提示氟代衍生物对革兰阳性菌和真菌活性增强、甲氧基取代物对革兰阴性菌活性较好，其中化合物 7b 与 7f 活性最具前景；该结论为体外筛选与对接层面的「提示」，尚不足以支持临床有效性。 设计与做法：属化学合成与体外活性筛
从头设计黄素蛋白并调控其激发态动力学
结论方向：该预印本报告了一套计算设计框架，可在从头设计蛋白中调控黄素的激发态行为，并据此获得热稳定的黄素结合蛋白；属设计验证性结果，尚不足以支持任何应用层面的结论。 设计与做法：研究为计算设计加超快光谱表征的整合研究，结合蛋白设计、QM/MM MD 与电子结构计算，迭代设计得到
聚乙烯纳米塑料链长依赖的人过氧化氢酶相互作用模拟
结论方向：该预印本提示短链聚乙烯片段可能抑制人过氧化氢酶，而长链片段更倾向停留在外周表面；结论来自计算模拟，属提示性证据，不足以判定实际毒性。 设计与做法：研究采用分子对接与全原子分子动力学模拟，比较重复单元数 n=3、5、7、14 的聚乙烯寡聚物与人过氧化氢酶（四聚体血红素酶）
Large-scale prospective evaluation of co-folding across hundreds of Mac1–ligand complexes and three virtual screens
Abstract Accurate prediction of ligand-bound protein complexes and ranking them by affinity are central problems in drug discovery. While de
靶向FAP小分子光敏剂用于光动力疗法的设计、合成与临床前评价
结论方向：该文献为期刊出版资讯条目，仅提供文章题录信息，未包含摘要内容，因此无法就 FAP 靶向小分子光敏剂的设计、合成与临床前评价给出方向性结论；当前「不足以下结论」。 研究设计与做法：材料仅显示为 European Journal of Medicinal Chemistry
MolSanitizer：面向大规模虚拟筛选的开源小分子数据库准备流程
结论：MolSanitizer作为基于RDKit的开源分子准备流程，在基准测试中表现优于若干免费软件，并与商业软件性能相当，提示其可用于大规模虚拟筛选前的数据库准备，证据档位C。 设计与做法：为工具开发与基准测试类研究，构建开源流程，包含化学环境感知的质子化与互变异构规则、系统性
现代药物发现与开发的创新策略综述
结论方向：综述认为近二十年计算、生物与工程进展正逐步改变药物研发流程，AI/ML、多组学、基因编辑、类器官与精准医学等新策略已渗透各阶段；证据档位为C，属叙述性综述，方向为总体积极但未给出量化效应。 研究设计与做法：为叙述性/批判性综述，非原始研究；材料未报告样本量、干预与对照、
OpenFermion：面向量子计算机的电子结构计算工具包
OpenFermion 是一个开源 Python 包，用于编译和分析模拟费米子系统（包括量子化学）的量子算法，提供费米子与量子比特哈密顿量的表示与操作工具。
体力活动改善骨骼肌胰岛素敏感性的计算生物标志物与化合物筛选
结论：该假设生成型研究提示WNT4可能参与骨骼肌胰岛素敏感性的动态调控，并提出“内源性代偿—阶段转换”功能假说及候选化合物库；所有发现均为计算预测，方向为提示性，尚不足以下结论。 设计与做法：整合生物信息学与计算化学，使用公共数据集；骨骼肌数据集GSE24215（n=10）为卧床
CDK6结构导向药物重定位：319种非抗肿瘤药物的分子对接与动力学分析
通过分子对接与分子动力学模拟，度他雄胺、达那唑与氮卓斯汀被识别为可稳定占据CDK6 ATP结合位点的候选骨架，其中氮卓斯汀预测结合能最接近参照抑制剂阿贝西利；但均为计算预测，尚无生化或细胞层面证据支持其生物学相关性。 研究为计算结构生物学方法：以预测的人CDK6-Cyclin D
黑种草生物活性成分抗MRSA的系统综述与计算分析
该系统综述结合分子对接、分子动力学模拟与ADMET分析提示，黑种草中的百里醌与香芹酚可能通过作用于MRSA关键耐药蛋白PBP2a发挥抗MRSA作用，对香芹酚与百里醌的结合亲和力强于对伞花烃与反式茴香脑；整体为体外与计算证据，档位B，尚不足以下临床结论。 研究按PRISMA 202
监督分子动力学模拟捕捉HuR结构域闭合过程
该研究用分子动力学模拟比较HuR的apo开放态与RNA结合闭合态，发现常规模拟无法捕捉开放到闭合的转变，遂将监督分子动力学（SuMD）拓展用于分子内结构域闭合，成功重现类实验RNA结合构象并提出可能的再闭合路径；结果提示该方法可扩展至分子内构象转变研究，属计算模拟层面的机制提示。
巴西蛋白质工程1988至2026年生物物理视角系统综述
对1988年至2026年6月间巴西机构相关的蛋白质工程研究进行系统综述，共纳入792篇同行评议文献，提示该领域已从早期残基水平突变与常规生化检测，发展为实验与计算深度整合的成熟多元领域，生物物理已从描述性角色转向工程蛋白设计与验证的核心。 研究设计为系统综述，检索PubMed，采
分子对接与ADMET筛选Hyptis verticillata中天然TGF-β1抑制剂
结论：分子对接结果显示Hyptis verticillata来源的齐墩果酸等植物化学物与TGF-β1结合亲和力较强，提示其可能具有抑制TGF-β1信号的潜力；属计算预测，方向为结合亲和力层面的提示，未涉及生物活性验证。 设计与做法：属计算/分子对接研究。作者从PubChem获取H
SLC6转运体配体理性设计的分子模拟与QSAR策略综述
该综述提示，2020年1月至2026年8月间，计算模拟方法（LBDD、SBDD与AI整合流程）在SLC6转运体抑制剂早期发现中可能有助于新型骨架识别与选择性、构象特异性设计，但作为综述其结论属观点性总结，不足以下结论认为可提升临床结局。 研究设计为文献综述，检索PubMed、Em
哌嗪-吡啶偶联物的醛糖还原酶抑制与抗氧化体外评价
合成的哌嗪-吡啶偶联类似物在体外对醛糖还原酶显示抑制活性，其中部分化合物的IC50低于参照药Sorbinil，提示该类结构具有进一步研究的可能，但证据仅来自体外与计算层面。 研究为化合物合成与体外/计算机评价研究：经波谱学表征结构，开展分子对接（靶点4JIR）、DFT分析、in
氮官能化2-脱氧sp2-亚氨基糖脂的立体选择性合成与生物评价
结论：材料仅提供该文献的题录信息（标题、期刊、日期与作者），未提供摘要正文，因此无法就合成路线、立体选择性结果或生物活性方向给出结论；现有信息不足以形成任何效应方向的判断。 设计与做法：材料未报告研究设计与具体做法，仅从标题可知涉及氮官能化2-脱氧sp2-亚氨基糖脂的立体选择性合
新型噻唑基脲DFMNTU靶向黄热病毒与宿主CK2
在Vero细胞中，新合成的噻唑基脲类化合物DFMNTU对黄热病毒17D株诱导的细胞病变具有抑制作用，并提示宿主激酶CK2为其可能靶点；该结果属体外与计算层面的早期hit发现，尚不足以支持体内或临床抗病毒结论。 研究为体外细胞学与计算机辅助药物发现研究：合成DFMNTU并经NMR、
MdDOX-Co同源物揭示新型赤霉素代谢支系与单残基催化开关
证据支持：在实验体系中，MdDOX-Co同源物在赤霉素羟化位点上呈现分化，可分为具12α-羟化活性与具2-羟化活性两类；单残基替换T214P可将催化活性由12α-羟化转为2β-羟化。 设计为分子与生化研究，结合系统发育分析、重组酶生化实验与GC-MS检测，并采用酶结构预测、分子对
化学方向雷达 · 2026-W40｜计算流水线化、RNA口袋、绿色CADD
化学方向雷达：计算筛选流水线化、RNA小分子口袋挖掘、多靶点通路协同假说。计算类条目占据压倒性多数，提问方式已从“这个化合物有没有活性”转向“用什么模型、什么参数、什么靶点构象去筛”。
