从头设计塑造半合成导电蛋白孔道
研究通过从头设计构建半合成导电蛋白孔道。 摘要缺失,无法获知具体设计策略与实验方法。
研究通过从头设计构建半合成导电蛋白孔道。 摘要缺失,无法获知具体设计策略与实验方法。
在300 K下模拟4000 ns,考察不同浓度P188对两种完整AAV8衣壳结构稳定性与聚集行为的影响。 采用粗粒化分子动力学方法,分析质心间距、残基接触、表面覆盖度、范德华作用、回转半径与相对形状各向异性等指标。
研究结合荧光淬灭、ANS结合、FRET与分子对接,表征溶菌酶部分折叠中间态的结构与热力学特征。 以丙烯酰胺和碘离子作淬灭剂考察极端pH下溶菌酶构象变化,并用GuSCN、HFIP和TFE诱导构象改变。
研究构建计算性假设生成框架,将肠道菌群相关代谢物与骨质疏松关联,并保留上游微生物来源与底物信息。 基于gutMGene、PubChem获取代谢物与肠道宿主靶点,用SEA和SwissTargetPrediction预测候选靶点,从CTD、GeneCards、OMIM获取骨质疏松靶点
标题提示醛类可通过三羰基化级联反应实现苏糖呋喃糖的从头合成。 因仅有标题、无摘要,反应条件、催化剂与底物范围等设计细节不明。
综述认为整合网络药理学、分子对接与分子动力学模拟可为药物发现提供较全面的计算框架。 采用计算机模拟综述方式,梳理三类方法在靶点识别、机制探索、虚拟筛选与先导优化中的分工。
研究提示紫草素对部分PKM2突变体可能通过突变诱导的新口袋实现识别,而非仅依赖野生型的经典活性位点。 采用分子对接与1微秒分子动力学模拟,比较紫草素在野生型PKM2及六种突变体中的结合模式与构象动态。
β-侧柏素在非小细胞肺癌细胞中表现出浓度依赖性细胞毒性。 以H460、A549肺癌细胞及L132正常肺上皮细胞为对象,采用MTT、NRU、SRB法检测。
化学方向雷达:多维虚拟筛选流水线化、重定位与靶点证据整合、AI模型对齐化学家判断。本期语料里计算类条目占据压倒性多数,提问方式已从“这个化合物有没有活性”转向“用什么模型、什么参数、什么靶点构象去筛”。
集成多种归纳偏置模型,可使逆合成预测更贴近化学家的判断方式。 研究采用模型集成策略,将具有不同归纳偏置的模型组合用于逆合成任务。