巴西蛋白质工程1988至2026年生物物理视角系统综述
对1988年至2026年6月间巴西机构相关的蛋白质工程研究进行系统综述，共纳入792篇同行评议文献，提示该领域已从早期残基水平突变与常规生化检测，发展为实验与计算深度整合的成熟多元领域，生物物理已从描述性角色转向工程蛋白设计与验证的核心。 研究设计为系统综述，检索PubMed，采
监督分子动力学模拟捕捉HuR结构域闭合过程
该研究用分子动力学模拟比较HuR的apo开放态与RNA结合闭合态，发现常规模拟无法捕捉开放到闭合的转变，遂将监督分子动力学（SuMD）拓展用于分子内结构域闭合，成功重现类实验RNA结合构象并提出可能的再闭合路径；结果提示该方法可扩展至分子内构象转变研究，属计算模拟层面的机制提示。
黑种草生物活性成分抗MRSA的系统综述与计算分析
该系统综述结合分子对接、分子动力学模拟与ADMET分析提示，黑种草中的百里醌与香芹酚可能通过作用于MRSA关键耐药蛋白PBP2a发挥抗MRSA作用，对香芹酚与百里醌的结合亲和力强于对伞花烃与反式茴香脑；整体为体外与计算证据，档位B，尚不足以下临床结论。 研究按PRISMA 202
CDK6结构导向药物重定位：319种非抗肿瘤药物的分子对接与动力学分析
通过分子对接与分子动力学模拟，度他雄胺、达那唑与氮卓斯汀被识别为可稳定占据CDK6 ATP结合位点的候选骨架，其中氮卓斯汀预测结合能最接近参照抑制剂阿贝西利；但均为计算预测，尚无生化或细胞层面证据支持其生物学相关性。 研究为计算结构生物学方法：以预测的人CDK6-Cyclin D
体力活动改善骨骼肌胰岛素敏感性的计算生物标志物与化合物筛选
结论：该假设生成型研究提示WNT4可能参与骨骼肌胰岛素敏感性的动态调控，并提出“内源性代偿—阶段转换”功能假说及候选化合物库；所有发现均为计算预测，方向为提示性，尚不足以下结论。 设计与做法：整合生物信息学与计算化学，使用公共数据集；骨骼肌数据集GSE24215（n=10）为卧床
现代药物发现与开发的创新策略综述
结论方向：综述认为近二十年计算、生物与工程进展正逐步改变药物研发流程，AI/ML、多组学、基因编辑、类器官与精准医学等新策略已渗透各阶段；证据档位为C，属叙述性综述，方向为总体积极但未给出量化效应。 研究设计与做法：为叙述性/批判性综述，非原始研究；材料未报告样本量、干预与对照、
MolSanitizer：面向大规模虚拟筛选的开源小分子数据库准备流程
结论：MolSanitizer作为基于RDKit的开源分子准备流程，在基准测试中表现优于若干免费软件，并与商业软件性能相当，提示其可用于大规模虚拟筛选前的数据库准备，证据档位C。 设计与做法：为工具开发与基准测试类研究，构建开源流程，包含化学环境感知的质子化与互变异构规则、系统性
靶向FAP小分子光敏剂用于光动力疗法的设计、合成与临床前评价
结论方向：该文献为期刊出版资讯条目，仅提供文章题录信息，未包含摘要内容，因此无法就 FAP 靶向小分子光敏剂的设计、合成与临床前评价给出方向性结论；当前「不足以下结论」。 研究设计与做法：材料仅显示为 European Journal of Medicinal Chemistry
Large-scale prospective evaluation of co-folding across hundreds of Mac1–ligand complexes and three virtual screens
Abstract Accurate prediction of ligand-bound protein complexes and ranking them by affinity are central problems in drug discovery. While de
从头设计黄素蛋白并调控其激发态动力学
结论方向：该预印本报告了一套计算设计框架，可在从头设计蛋白中调控黄素的激发态行为，并据此获得热稳定的黄素结合蛋白；属设计验证性结果，尚不足以支持任何应用层面的结论。 设计与做法：研究为计算设计加超快光谱表征的整合研究，结合蛋白设计、QM/MM MD 与电子结构计算，迭代设计得到
