紫草素经突变诱导口袋识别靶向癌症相关PKM2突变体的分子研究
研究提示紫草素对部分PKM2突变体可能通过突变诱导的新口袋实现识别，而非仅依赖野生型的经典活性位点。 采用分子对接与1微秒分子动力学模拟，比较紫草素在野生型PKM2及六种突变体中的结合模式与构象动态。
三唑类化合物治疗三阴性乳腺癌的分子机制研究进展
结论方向：该综述提示三唑类化合物因结构多样、化学稳定且可作用于多靶点，具备抗三阴性乳腺癌（TNBC）的治疗潜力，相关机制涵盖凋亡诱导、细胞周期阻滞、抑制血管生成与转移及调控主要致癌信号通路；证据档位B，属临床前层面的提示。 研究设计与做法：为综述性文章，汇总三唑衍生物的化学特征、
铜基配位聚合物：尿素酶/硝化双功能抑制剂（对接 + 动力学 + 土壤验证）
结构设计：水热法合成两个新铜基配位聚合物 Cu-CP-1 与 Cu-CP-2，目标是同时延缓尿素水解与抑制硝化，以提高氮肥利用率。 活性：尿素酶抑制 IC₅₀ 分别为 3.40 ± 0.01 µM 与 9.15 ± 0.04 µM，显著优于其有机配体与参照抑制剂。 机制：动力学
基于Kirkwood-Buff理论的分子动力学模拟计算多组分混合物水活度
该研究提示，将Kirkwood-Buff理论推广至任意独立热力学组分数目的多组分水溶液后，可由分子动力学轨迹估算水活度，计算结果再现了主要实验趋势，但属方法学探索，尚不足以作为定量标准。 设计为分子动力学模拟方法学研究：以KB理论为基础，采用广义公式对所需化学势导数进行数值求解，
大语言模型用于药物发现：应用与未来方向的系统综述
系统综述梳理大语言模型在药物研发各阶段的应用现状与未来方向。 遵循PRISMA 2020规范，检索2018至2025年PubMed、Scopus、Web of Science与Google Scholar文献。
溶菌酶天然样与螺旋熔球态的结构与热力学表征：ANS结合与分子对接
研究结合荧光淬灭、ANS结合、FRET与分子对接，表征溶菌酶部分折叠中间态的结构与热力学特征。 以丙烯酰胺和碘离子作淬灭剂考察极端pH下溶菌酶构象变化，并用GuSCN、HFIP和TFE诱导构象改变。
致突变性预测：QSAR + read-across + 深度学习的可解释流水线（Enalos 云平台）
目标：以 Ames 试验（细菌基因突变）数据构建非动物替代方法（NAM），支撑"安全可持续设计（SSbD）"化学品，在早期识别潜在危害物；数据做了立体特异性整理。 融合：三模型多数投票，外部验证准确率 83%，可降低单一模型偏置。 可解释性：用 XAI 解释关键描述符，为致突变机
来那度胺用于难治性白塞病：系统综述与计算药理学探索
该研究提示来那度胺重定位用于难治性白塞病是具有前景的策略，但结论基于临床病例与计算分析。 研究纳入临床病例报告的系统综述，并采用毒理预测、网络药理学筛选共同靶点、蛋白互作网络构建及分子对接等计算手段。
交联位点位置对聚合物网络拓扑结构与力学性能影响的分子动力学模拟
结论：交联位点位置影响聚合物网络的拓扑结构，并进而改变其力学响应。 设计：采用分子动力学模拟，考察交联位点位置、位点间距与交联密度对网络的影响。
多维虚拟筛选与动力学模拟发现新型TRPV1拮抗剂及其机制分析
通过多维虚拟筛选结合动力学模拟，识别出新型TRPV1拮抗剂并分析其作用机制。 摘要仅为期刊出版信息，未说明筛选流程、化合物数量或模拟参数等设计细节。
槐耳通过IL-2/PI3K-Akt免疫调节治疗肝细胞癌的预测机制
该研究初步提示槐耳辅助治疗肝细胞癌可能涉及IL-2/PI3K-Akt免疫调节机制。 采用meta分析评估临床疗效，并整合网络药理学、生物信息学、分子对接、分子动力学模拟与细胞实验。
小檗碱治脂肪肝（MASLD）：网络药理学 + 对接 + 体外验证
Cytotechnology · 2026-09-04 · 期刊论文 网络药理学得 147 个交集靶点、6 个核心靶（AKT1 / IL6 / TP53 / TNF / IL1B / BCL2），富集指向胰岛素抵抗 / 脂代谢 / 炎症；分
GS-441524（瑞德西韦活性代谢物）被重定位为抗毒力剂：抑制蜡样芽孢杆菌生物膜
背景：蜡样芽孢杆菌是顽固的食源性致病菌，其生物膜形成与毒力受群体感应（QS）调控。 思路：不杀菌，而是走抗毒力（anti-virulence） 路线 —— 评估 GS-441524（瑞德西韦的活性代谢物）的作用。 体外结果：在亚抑菌浓度下，GS-441524 剂量依赖地降低蛋白酶
可移动糖基化位点调控卷曲乳杆菌细胞壁结构（长读长测序 + 分子动力学）
背景：卷曲乳杆菌（Lactobacillus crispatus）在阴道微生物组中占优与更好的健康结局相关，但菌株水平变异及其意义仍不清楚。 定位：解析此前与菌群失调状态相关的三个糖基转移酶基因片段（GT1–3）的基因组上下文。 结构发现：长读长重测序显示 GT1–3 属于一个约
DHA-水杨醛-查尔酮-1,2,3-三唑杂合物的合成与α-葡萄糖苷酶抑制研究
结论：合成的DHA-水杨醛-查尔酮-三唑杂合物在体外显示α-葡萄糖苷酶抑制活性，其中4k最强。 设计：合成并表征系列杂合物4a-4l，行体外α-葡萄糖苷酶抑制测定，并以计算机模拟佐证。
抗结核先导 IIIM-019：自乳化递药系统（SEDDS）提升生物药剂学性能
AAPS PharmSciTech · 2026-09-09 · 期刊论文 硝基咪唑类抗结核先导 IIIM-019 存在 水溶性差 的成药性瓶颈。研究构建脂质自乳化递药系统（SEDDS）以突破该限制。 最优处方 F2：粒径 120.6 ±
（方法亮点）SAM-I 核开关：单分子磁力光谱 vs SPR / ITC
RNA Biology · 2026-09-02 · 期刊论文 用"可缩放磁力光谱（MFS）"并行分析数百单分子，在高 / 低镁条件下测量 SAM / SAH 与 SAM-I 核开关的结合亲和力，结果与 SPR、ITC 一致，还额外给出构象
双噁二唑类α-淀粉酶与α-葡萄糖苷酶配体的设计合成及计算评价
研究设计并合成双噁二唑衍生物，评估其作为α-葡萄糖苷酶和α-淀粉酶抑制剂的抗糖尿病潜力。 通过多步有机合成制备目标化合物，用FTIR、NMR、HRMS确证结构，并开展体外酶抑制实验及DFT、分子对接与ADME计算研究。
通痹灵丁治疗骨关节炎活性成分与机制的多组学研究
基于多组学与实验验证，初步揭示通痹灵丁治疗骨关节炎的潜在活性成分及分子机制。 采用DMM诱导小鼠OA模型与IL-1β刺激软骨细胞，结合UPLC-MS/MS、网络药理学、转录组学与分子对接。
计算设计与优化中药化合物抑制大肠杆菌gyraseB
研究以计算手段筛选中药化合物库，寻找靶向大肠杆菌DNA旋转酶B亚基的潜在抑制剂。 针对PDB 6F86靶点，依次采用机器学习模型、药效团过滤、Lipinski规则评估、分子对接与MM/GBSA计算。
