十年变暖与海草热耐受及转录组重编程的关联
结论方向：2017年与2022年采自亚喀巴湾的热带海草Halophila stipulacea在模拟热胁迫下表现不同，2022年植株维持正常生长与光化学，提示其热耐受性较2017年植株增强；该关联性结论来自预印本，证据档位C，尚不足以下结论。 研究设计与做法：采用中宇宙（meso
坏死性凋亡与宫颈癌进展及治疗的系统综述与转录组跨研究共识分析
结论方向：该综述与探索性转录组分析提示，坏死性凋亡激活在宫颈癌中总体与免疫浸润和免疫激活增强、预后改善相关，作者据此认为坏死性凋亡是值得关注的潜在干预靶点；证据档位为B，属综述与二次分析层面的支持，而非干预性验证。 研究设计与做法：按PRISMA指南开展系统综述，纳入7个已发表的
伯氏朴丽鱼求偶期视前区转录组同步与行为协调
在伯氏朴丽鱼（Astatotilapia burtoni）中，雌雄配对求偶时视前区（POA）转录组呈现高度同步，且同步程度主要取决于雌性的生殖反应性，提示雌性行为驱动自然繁殖的分子层面镜像。该结论来自预印本，属提示性证据。 研究采用实验诱导设计：对雌雄配对给予外源前列腺素F2α（
ESR1突变乳腺癌多组学特征与MTORC1信号及复发风险签名
结论方向：ESR1突变乳腺癌呈现更高的突变负荷与细胞增殖特征，并表现出MTORC1通路激活增强，作者据此提出ER驱动的既有致癌机制放大；该结论基于多组学关联分析，属提示性证据，不足以确立因果。 研究设计与做法：对携带ESR1突变的肿瘤进行转录组、蛋白质组与磷酸化蛋白质组分析，并纳
（方法亮点）NanoCAGE：病毒如何"劫持"宿主翻译
Virulence · 2026-09-03 · 期刊论文 用 NanoCAGE-seq 描绘人巨细胞病毒（HCMV）感染后宿主替代性转录起始位点（TSS）的切换全景：核糖体蛋白基因富集，感染期整体转录虽下调、蛋白却反常累积——替代 5'U
腔隙性卒中：甘氨酸与中密度 LDL 胆固醇占比的逆向关联（2408 人 + 孟德尔随机化）
背景：腔隙性卒中源于脑小血管病（SVD），是血管性痴呆与认知衰退的重要原因；本研究评估代谢物与腔隙性卒中、SVD 影像标志物及认知的关联。 英国多中心临床队列，MRI 确诊腔隙性卒中病例与非相关医院对照；用 NMR 波谱检测 250 种血清代谢物；对每种代谢物做全基因组关联分析，
成纤维细胞相关TPM2连接细胞基质重塑与肝内胆管癌吉西他滨耐药
成纤维细胞相关TPM2可能将细胞基质重塑与EMT-Notch信号及吉西他滨耐药相联系。 整合4个单细胞RNA测序数据集共50176个细胞，并结合TCGA转录组与药敏分析。
编码与非遗传蛋白变体扩展人类功能蛋白质组
标题提示编码与非遗传来源的蛋白变体可扩展人类功能蛋白质组，但摘要缺失，具体结论无法确认。 因无摘要，研究设计、样本量、干预与对照等信息均不可知，仅能依据标题谨慎概括。
SIV持续储存库的组织病毒微环境与应激反应激活
在SIV感染猕猴模型中，持续储存库的病毒反弹源自肠黏膜内转录活跃的离散病灶，其组织状态以应激反应、代谢、线粒体与细胞周期程序激活为特征，证据档位为预印本，提示病毒微环境可能参与储存库持久性。 研究采用免疫PET/CT引导采样结合空间转录组学，比较感染后早期启动ART（短暂储存库）
焦亡相关 lncRNA：乳腺癌预后与免疫微环境 signature
Cell Cycle · 2026-09-06 · 综述 综述焦亡相关 lncRNA 在乳腺癌进展与免疫中的调控：转录组分析得到的预后 signature 能把患者分层——低危组富集 CD8+ T / NK / B 浸润与免疫检查点表达，高
生命科学方向雷达 · 2026-W41｜单细胞坐标化、多组学整合、方法学工具化
生命科学方向雷达：细胞状态坐标化：从聚类到定位、多源证据链整合：从单组学到跨模态、方法学与流程可复现：从结果到审计。本期提问从“有没有差异”转向“坐标与状态怎么定”：单细胞研究普遍先做细胞类型与状态坐标化，再谈差异表达。
DeepVariant：基于深度学习的胚系变异检测流程
DeepVariant 是一个用卷积神经网络从二代测序比对数据中检测遗传变异的分析流程，输入 BAM/CRAM，输出标准 VCF 或 gVCF。
Metabonaut：面向可重复脚本化非靶向LC-MS/MS代谢组学的开放教育资源
该教育性综述提出，非靶向LC-MS/MS代谢组学中从原始文件到特征表的分析流程难以共享、审计与复用，并以开放教育资源Metabonaut为例，展示如何将FAIR原则从数据延伸至分析流程，属方法学与教育层面的论述而非实证疗效研究。 研究类型为教育性综述，基于R for Mass S
稻瘟病菌种复合体：宿主专一化的"受限可塑性"框架
背景：稻瘟病威胁全球水稻生产，小麦瘟的出现说明该病原具备宿主跳跃能力；Magnaporthe oryzae 并非均一种，而是遗传分化、宿主适应的谱系复合体。 框架：整合演化基因组学、转录组学与代谢组学，提出"受限可塑性（Constrained Plasticity）"，认为宿主适
GWAS与基因编辑解析紫花苜蓿MsCBF8-MsGolS2耐旱调控模块
该研究提示，MsCBF8作为耐旱正调控因子，通过直接结合MsGolS2启动子GCCGAC顺式元件激活其表达，过表达可增强苜蓿耐旱性且不损害生长，但结论主要来自同源四倍体背景下的遗传与生理实验。 设计为遗传学功能研究：在苜蓿中开展全基因组关联分析（GWAS）鉴定出CBF/DREB1
胶质母细胞瘤与结直肠癌：保守 miRNA 网络调控 PD-1/PD-L1
筛出 5 个在 GBM 与 CRC 中一致失调的保守 miRNA：miR-106a-5p、miR-106b-5p、miR-20a-5p、miR-20b-5p、miR-138-5p。 上调组：miR-106a/106b-5p 在两癌中均上调且预后较好（表达越高生存越好）；miR-2
ROMO1 与类风湿关节炎：GWAS/孟德尔随机化 + 单细胞 + 空间的四层整合
Autoimmunity · 2026-09-05 · 期刊论文 用孟德尔随机化（MR）+ 差异表达 + 机器学习选特征锁定线粒体 ROS 调控因子 ROMO1；再以单细胞 RNA + 空间转录组，把 ROMO1 相关免疫细胞定位到滑膜微环
整合转录组与单细胞分析提示CD74为肾结石肾小管细胞铁死亡候选调控因子
研究提示CD74可能与肾结石中肾小管上皮细胞的铁死亡相关损伤有关，并可能涉及NF-κB信号通路。 采用乙醛酸诱导小鼠模型，结合批量转录组、蛋白互作与单细胞分析，观察草酸钙沉积、肾功能及铁死亡相关指标变化。
BioMod：以生物模块为单元的单细胞基础模型
作者提出以生物模块作为基因与细胞之间的中间表征单元，构建了约5000万参数的单细胞基础模型BioMod，并在细胞类型注释、零样本批次整合、扰动响应预测与药物响应预测等任务上报告了当前最优性能，方向为性能提升，但属预印本证据。 研究为方法学建模工作：构建了由人工整理通路与数据驱动基
ProST：图像提示引导的多模态表征学习用于空间域识别
作者提出ProST框架，在多个空间转录组数据集上报告其在空间域识别、可视化、空间轨迹推断与基因表达填补方面一致优于现有方法；该结论基于作者自选数据集的基准比较，属方法学提示性证据，尚不足以断言普适优越性。 研究为计算方法的开发与基准评测，非临床研究。ProST以组织学图像作为图像
