成纤维细胞相关TPM2连接细胞基质重塑与肝内胆管癌吉西他滨耐药
成纤维细胞相关TPM2可能将细胞基质重塑与EMT-Notch信号及吉西他滨耐药相联系。 整合4个单细胞RNA测序数据集共50176个细胞,并结合TCGA转录组与药敏分析。
成纤维细胞相关TPM2可能将细胞基质重塑与EMT-Notch信号及吉西他滨耐药相联系。 整合4个单细胞RNA测序数据集共50176个细胞,并结合TCGA转录组与药敏分析。
单细胞RNA测序提示,STXBP1相关障碍模型中不同神经元类型存在易损性差异。 因摘要缺失,仅据标题推断:采用单细胞RNA测序,在STXBP1相关障碍模型上比较神经元类型。
提出SVPG,一种基于泛基因组的结构变异检测方法,并支持用新样本快速扩充泛基因组图。 因摘要缺失,仅据标题推断:方法类研究,可能包含算法构建与在新样本上的检测/扩充验证。
蛋白相互作用研究揭示了基因组中此前未被识别的连接关系。 研究以蛋白相互作用为切入点,解析基因组内部的组织与连接方式。
构建人发育期海马寿命单细胞图谱,用于基准化家族性阿尔茨海默病脑类器官。 fAD由APP、PSEN1或PSEN2常染色体显性变异引起,海马是AD最早且受累最重的脑区之一。
DeepVariant 是一个用卷积神经网络从二代测序比对数据中检测遗传变异的分析流程,输入 BAM/CRAM,输出标准 VCF 或 gVCF。
探讨失去变态发育对溪螈(Brook Salamanders)眼内视蛋白及光转导相关基因表达的影响。 研究以溪螈为对象,比较视蛋白与光转导基因在眼内的表达,具体实验设计与样本量摘要未给出。
研究提出SPHERE-PCA方法,将单细胞基因表达的主导主成分投影到单位球面,以获得可解释的坐标系统。 方法对前三个主成分坐标做L2归一化,将生物学定义的根节点对齐北极,用测地距离θ、角位置φ与投影前径向幅度r表示每个细胞。
该文为更正声明,针对已发表溃疡性结肠炎转录组学研究中若干结果表述进行澄清。 读者就单细胞RNA测序数据来源与分组呈现提出疑问,作者据此对材料方法及结果描述作出说明。
该文探讨以大规模插入片段实现基因编辑的策略,具体结论受限于仅有标题的信息。 因摘要缺失,无法确认研究设计、样本量或实验体系,仅知属基因编辑方法类工作。
结论:该研究关注基因对人格特征与个体经历的塑造作用,但摘要缺失,具体结论无法确认。 设计与做法:仅据标题推测,可能采用遗传学与人格或经历表型的关联分析设计,细节未知。
Biopython 是面向计算分子生物学的开源 Python 工具集,提供序列处理、比对、系统发生与蛋白结构等常用功能,帮助研究者用 Python 完成生物信息学分析。
过表达睾丸富集的lincRNA可在体细胞中引起转录组与蛋白质组改变,并削弱DHX36活性与整体蛋白合成。 研究针对LTR12相关lincRNA lnc-ARRDC4-1与lnc-ADCYAP1-2,在体细胞中提高其表达并观察后果。
CDK4或CDK6上调可通过诱导DNA复制应激与基因组不稳定,促成肺癌EGFR靶向治疗耐药。 研究在EGFR突变肺腺癌背景下,考察CDK4/6过表达对EGFR抑制剂诱导增殖停滞的影响。
幼年社会隔离可诱导雌性小鼠伏隔核神经元出现基因表达改变与组蛋白修饰失调。 研究对神经元核进行RNA-seq,并开展差异基因的蛋白互作分析,聚焦伏隔核脑区。
BALB/c小鼠模型显示,MPXV Ib分支的致病性强于IIb分支,且两者抗病毒治疗结局存在差异。 建立鼻内接种MPXV Ib的BALB/c小鼠模型,并与IIb分支比较致病性及抗病毒治疗反应。
肠道共生菌柠檬肠梭菌及相关菌群物种可通过产生生物活性小分子调控霍乱弧菌生物膜形成。 研究以人粪便有机提取物观察霍乱弧菌基因表达,并用柠檬肠梭菌纯培养提取物进行验证。
评估17基因转录组替代指标在结直肠衰老与癌症中的构念效度及其证据边界。 该预印本聚焦构念效度与证据边界的分析,具体设计与方法因无摘要无法确定。
BE5.1可能以性别依赖方式调节早期生活应激对体重增长、焦虑及基因表达的影响。 采用母婴分离建立早期应激模型,比较BE5.1敲除小鼠与野生型小鼠。
研究提示卒中后抑郁不同严重度伴随特异的肠道菌群、代谢与炎症特征。 对91例不同严重度卒中后抑郁患者及非抑郁对照行宏基因组、非靶向代谢组与血清细胞因子检测。