肝内胆管癌：三级淋巴结构异质性的时空图谱（214 + 155 例 + 空间多组学）
Science Advances · 2026-09-09 · 期刊论文 肝内胆管癌（iCCA）预后极差、治疗选择有限。本研究构建了三级淋巴结构（TLS）的 多模态空间图谱 ，确认 肿瘤内 TLS（iTLS）为独立预后标志物 。 蛋白组学：
TXNRD1 经 TGF-β1 自分泌环路驱动非小细胞肺癌可塑性与干性
Cancer Biology & Therapy · 2026-09-08 · 期刊论文 在 TCGA/GEO 中分析分期进展基因谱（聚焦氧化还原基因家族），发现 TXNRD1（硫氧还蛋白还原酶 1）在晚期 NSCLC 中表达 约高 2 倍
慢性肾病的炎症与代谢"昼夜节律重编程"（4 小时间隔时序 RNA-seq）
Renal Failure · 2026-09-06 · 期刊论文 对对照与 CKD 小鼠肾脏组织做 4 小时间隔的时序 RNA 测序 ，用 JTK_CYCLE 算法识别节律基因并按"丢失 / 获得 / 维持"分类，再做聚焦式生物信息分析。
ROMO1 与类风湿关节炎：GWAS/孟德尔随机化 + 单细胞 + 空间的四层整合
Autoimmunity · 2026-09-05 · 期刊论文 用孟德尔随机化（MR）+ 差异表达 + 机器学习选特征锁定线粒体 ROS 调控因子 ROMO1；再以单细胞 RNA + 空间转录组，把 ROMO1 相关免疫细胞定位到滑膜微环
焦亡相关 lncRNA：乳腺癌预后与免疫微环境 signature
Cell Cycle · 2026-09-06 · 综述 综述焦亡相关 lncRNA 在乳腺癌进展与免疫中的调控：转录组分析得到的预后 signature 能把患者分层——低危组富集 CD8+ T / NK / B 浸润与免疫检查点表达，高
（方法亮点）NanoCAGE：病毒如何"劫持"宿主翻译
Virulence · 2026-09-03 · 期刊论文 用 NanoCAGE-seq 描绘人巨细胞病毒（HCMV）感染后宿主替代性转录起始位点（TSS）的切换全景：核糖体蛋白基因富集，感染期整体转录虽下调、蛋白却反常累积——替代 5'U
胶质母细胞瘤与结直肠癌：保守 miRNA 网络调控 PD-1/PD-L1
筛出 5 个在 GBM 与 CRC 中一致失调的保守 miRNA：miR-106a-5p、miR-106b-5p、miR-20a-5p、miR-20b-5p、miR-138-5p。 上调组：miR-106a/106b-5p 在两癌中均上调且预后较好（表达越高生存越好）；miR-2
肝内胆管癌：三级淋巴结构（TLS）的时空图谱与成熟连续谱
规模：多模态空间图谱；蛋白组 214 例发现 + 155 例验证，证明瘤内 TLS（iTLS）是独立预后标志物，并建立四层 TLS 微环境分类与随机森林 TLS 预测分类器。 结构：成像质谱流式（IMC）显示 iTLS⁺ 肿瘤具结构化免疫架构——M1 样组织驻留巨噬细胞、树突细胞
HYOU1 缺陷：内质网蛋白稳态失衡同时打击 B 细胞与中性粒细胞
对象：2 例携带双等位 HYOU1 变异、表现为原发性免疫缺陷的无关患者。患者 1 纯合 p.Pro444His（发育迟缓、低血糖、B 细胞减少、中性粒细胞减少）；患者 2 复合杂合（反复感染、肠病、低丙种球蛋白血症）。 分子层面：患者 1 的 HYOU1 转录正常但蛋白严重降低
非小细胞肺癌：TXNRD1 经 TGF-β1 自分泌环驱动细胞可塑性与干性
数据挖掘：在 TCGA 与 GEO 中分析分期进展相关基因谱（侧重氧化还原基因家族）；TCGA 显示 TXNRD1 在晚期 NSCLC 中表达约为 2 倍，并在肿瘤组织中验证。 细胞实验：在 A549、H226、H1299 中过表达或敲低 TXNRD1（CRISPR/Cas9 或
慢性肾病：肾脏昼夜节律转录组的"适应不良重编程"
对 CKD 与对照小鼠肾组织做 4 小时间隔时序 RNA-seq，用 JTK_CYCLE 判定节律基因，并分为"丢失 / 获得 / 保持"三类。 总体：肾脏节律谱被大幅改写，"获得节律"是主导模式，核心钟基因表达被打乱。 免疫炎症侧：CKD 中上调的获得节律基因富集于免疫炎症通路
稻瘟病菌种复合体：宿主专一化的"受限可塑性"框架
背景：稻瘟病威胁全球水稻生产，小麦瘟的出现说明该病原具备宿主跳跃能力；Magnaporthe oryzae 并非均一种，而是遗传分化、宿主适应的谱系复合体。 框架：整合演化基因组学、转录组学与代谢组学，提出"受限可塑性（Constrained Plasticity）"，认为宿主适
原发性纤毛运动障碍：首次解析"过渡区"原位结构，锁定两个致病基因
问题：纤毛过渡区（TZ）负责调控纤毛蛋白质组构成，但其分子结构、蛋白组成及对运动性纤毛病的贡献一直未被定义。 对人体多纤毛上皮细胞做原位冷冻电子断层扫描 + 亚断层平均，在亚纳米分辨率下解析 TZ 特异的二联微管，并鉴定出 9 个组成蛋白。 关键发现：ECT2L 与 DZANK1
系统性红斑狼疮：CD3×CD19 双抗 A-319 的 I 期结果（12 人 / 52 周）
立题：抗 CD19 CAR-T 深度清除 B 细胞可在难治性自身免疫病带来持久无药缓解，但需淋巴清除化疗、自体细胞制备与专门设施，可及性受限。双特异性 T 细胞衔接器（TCE）是"现货型"替代方案，但在风湿病领域缺对照性临床评估。 设计：该药首次用于本病的 I 期试验静脉治疗臂；
人工栽培虫草"子座败育"：青霉富集 + 微生物组网络失稳（多组学）
背景：冬虫夏草由真菌 Ophiocordyceps sinensis 寄生蝙蝠蛾科幼虫形成（子座 + 菌核），但人工栽培受"子座败育"制约，严重影响产量与品质；真菌—宿主昆虫—土壤三者互作至关重要。 多组学比较正常与异常发育样本，分析被真菌定殖的宿主幼虫与菌际土壤中的微生物群落与
腔隙性卒中：甘氨酸与中密度 LDL 胆固醇占比的逆向关联（2408 人 + 孟德尔随机化）
背景：腔隙性卒中源于脑小血管病（SVD），是血管性痴呆与认知衰退的重要原因；本研究评估代谢物与腔隙性卒中、SVD 影像标志物及认知的关联。 英国多中心临床队列，MRI 确诊腔隙性卒中病例与非相关医院对照；用 NMR 波谱检测 250 种血清代谢物；对每种代谢物做全基因组关联分析，
重析应激颗粒转录组提示线粒体RNA富集
重新分析公开人类应激颗粒转录组后，提示其中可能存在线粒体RNA富集。 研究整合多种应激条件、细胞类型与分离策略的公开数据，比较差速离心与邻近标记结果。
菌株分辨代谢组化学分型鉴定色氨酸与γ-谷氨酰肽为MGO-AGEs断裂后生元化合物
研究建立菌株分辨活性代谢组学框架，用于理性筛选具有MGO-AGEs断裂活性的后生元提取物以缓解羰基应激。 对来自113株细菌的177份胞内代谢物提取物进行非靶向代谢谱分析与体外MGO-AGEs断裂活性筛选，并开展菌株水平化学型比较分析。
从预测的细菌素到生态功能
综述指出基因组与宏基因组挖掘已发现大量预测细菌素位点，但其生态学解释明显滞后。 以细菌素为模型讨论抗菌基因预测的普遍问题：序列仅提示编码潜力，不能确立表达、产物部署、靶点结合或群落后果。
整合遗传与单细胞分析揭示巨噬细胞介导衰老与骨质疏松的关联
整合遗传与单细胞分析提示，巨噬细胞是连接衰老与骨质疏松的关键中介细胞类型。 基于UK Biobank表型观察分析与汇总统计的孟德尔随机化分析，并结合单细胞数据整合。
